山東醫學高等專科學校現設臨沂、濟南兩個校區，校本部設在臨沂。學校本部座落在風景秀麗的歷史文化名城臨沂市，校園環境優美，景色怡人。濟南校區座落在風景秀麗的泉城濟南南郊萬靈山北麓，交通便利，辦學環境優雅。
學校教學設備先進，建有臨床、護理、口腔、檢驗、藥學、康復、醫學影像等專業的8個高標準實驗中心及“賀林個性化醫療與轉化醫學”院士工作站1個，擁有現代化的計算機實驗室、語音實驗室和多媒體教室；實現了校園計算機網絡與因特網和中國教育科研網的連接。臨床教學基地有附屬醫院、附屬眼科醫院各1所，非隸屬附屬醫院8所，教學醫院、實踐教學醫院142所，分布于山東全省和北京、上海、天津、深圳、南京等大城市。
學校設有醫學系、護理系、口腔醫學系、醫學檢驗系、藥學系、醫學影像學系等10個教學系部，開設臨床醫學、口腔醫學、護理、涉外護理、助產、醫學檢驗技術、藥學、中藥、醫學影像技術、康復治療技術、口腔醫學技術、衛生檢驗與檢疫技術、衛生信息管理、藥品經營與管理、醫用電子儀器與維護、醫學影像設備管理與維護、醫療保險實務、康復工程技術、臨床工程技術、眼視光技術、藥物制劑技術、放射治療技術等22個專業。其中，護理、藥學兩個專業為教育部、財政部重點支持建設專業。
學校面向山東全省招生，并與北京、山西、內蒙古、遼寧、吉林、黑龍江、浙江、安徽、河南、廣西、貴州、陜西、甘肅、青海、寧夏等15個省市自治區對等招生。現有全日制在校生15997人。
2015年山東省發展改革委員會、山東省教育廳下達該校的普通專科招生計劃為4900人。其中，校本部2550人，招生分布為山東省2470人，內蒙古、浙江、安徽、貴州、甘肅、寧夏各5人，遼寧、吉林、黑龍江、河南、陜西各10人；濟南校區2350人，招生分布為山東省2270人，北京、山西、遼寧、黑龍江、浙江、廣西、貴州、陜西、青海、寧夏各5人，內蒙古、吉林、甘肅各10人。
根據山東省教育廳《關于下達2015年執業院校與本科高校對口貫通分段培養試點任務的通知》魯教高字（2015）7號文件，2015年山東醫學高等專科學校與山東中醫藥大學銜接“3+2”專本連讀計劃50人，專業為藥學，均為夏季高考理科類。
