會議要求，調查組要堅持科學嚴謹、實事求是、依法依規、注重實效的原則，全面、科學、客觀、公正地開展案件調查工作。對于在調查中故意隱瞞事實、弄虛作假、提供虛假情況的，要從嚴懲處。會議指出，這起非法經營疫苗案件，暴露出疫苗流通和使用中長期存在的管理漏洞和制度缺陷。要按照李克強總理等中央領導同志重要批示指示精神，從這次案件中深刻汲取教訓，舉一反三，推動建立健全監管法規制度體系，完善長效機制。
聯合調查組還專門召開了專題會議，聽取了山東省人民政府和濟南市人民政府對案件調查、處理工作的匯報，以及山東省公安、衛生計生、食品藥品監管等部門前期開展工作的情況匯報。
聯合調查組副組長公安部副部長黃明、監察部副部長陳雍、衛生計生委副主任王國強、食品藥品監管總局副局長吳湞，以及山東省人民政府省長郭樹清、副省長王書堅等出席會議，聯合調查組全體成員參加會議。
