水污染防治7省不屬規劃項目反獲補助
財政管理審計情況發現，預算分配與專項規劃銜接不夠，有些專項規劃之間也缺乏統籌協調。抽查18個省實施重點流域水污染防治“十二五”規劃情況發現，地方在具體確定項目時，9個省納入規劃的1684個項目（占44%）未得到中央補助，而7個省不屬于規劃范圍的2135個項目（相當于其規劃項目數的63%）獲得了補助。有些預算依據多個規劃分配資金，這些規劃目標要求不盡一致，不利于項目有序推進，如中央財政9個專項安排有高標準農田建設相關補助，預算分配依據的規劃中僅全國性規劃就有4個。
財政部為低執行率項目繼續代編預算
財政管理績效還需進一步提高。有的預算安排未充分考慮結轉結余。財政部對連續兩年執行率低于60%的可再生能源發展等3個項目繼續代編預算10.06億元，年底結轉8.89億元（占88%）；在國稅系統管理等5個項目上年結轉1.42億元的情況下，又安排預算1.31億元，年底結轉增至1.96億元。
部分關稅和進出口環節稅征繳入庫不及時。由于海關、銀行和國庫未全面聯網，實行紙質稅單核銷，滯壓稅款規模逐年增長，2015年有194.68億元稅款滯壓15天以上。抽查23個關區發現，有281戶企業應轉為稅款的保證金7.09億元超期未轉，平均超期38天，其中1070.71萬元超期3個月。
□部門案例
環保部
下屬單位重復申領1560萬元
2015年，所屬核與輻射安全中心采取重復申報基本建設項目有關費用的方式多申領預算資金1560萬元；所屬環境規劃院在項目預算中編報并支出與項目無關的中國環境科學學會會費4萬元。
交通部
所屬單位違規收費2.5億元
2012年至2015年，所屬中國交通通信信息中心未經報批自行收費25184.31萬元，其中2015年24263.9萬元。
2015年，所屬救助打撈局違規批準和組織下屬3個救助局開展經營活動，取得收入16884.7萬元。
2010年至2015年，所屬通信中心下屬公司在購買監理服務過程中，使用有關單位提供的假發票沖抵費用84.44萬元。
