薩帕塔沼澤生物保護區(Ciénaga de Zapata Biosphere Reserve),位于主島的南海岸,是古巴最大的保護區。這里是現存最大的古巴鱷棲息地,數量多達3000多只。兇猛的古巴鱷以其跳躍本領著稱,能長到近四米長,130多公斤重。
Guanahacabibes半島,位于古巴的最西角,被列為生物自然保護區和國家公園。它那迷人的原始海灘,使其在眾島嶼中獨樹一幟,魅力非凡。半島上有100多處湖泊、170多種鳥兒,以及眾多美麗的珊瑚礁。在Maria del Gorda國際跳水中心,您還能見到大量罕見的樹狀黑珊瑚。